朱载坖对于这些叛军是极为严厉的，罕见的严令殷正茂、李化龙和前线的各级将校，不准接受叛军投降，务必从严剿除，坚决将这些敢于反抗朝廷的叛军尽数剿灭，朱载坖的甚至命令官军征发狼兵，将这些瑶人的城寨等尽数予以捣毁，以免死灰复燃，对于这些叛军朱载坖要求将其全部歼灭，以保证大明对于广西的绝对掌握。
而同时在南洋水师的运载之下，第一批倭人已经抵达了安南，官军水师将这些倭人放在升龙府附近的海滩上，安南水师早就被大明水师消灭的差不多的，仅剩下的残余也都只敢龟缩在港口之内，这些倭人上岸之后，当然是按照他们的老套路分散袭扰安南的乡村，劫掠屠杀安南人。
安南军队当然不能够放任这种行为，尤其是在首都升龙府附近，安南军队派遣重兵，想要将这些倭人予以歼灭，安南原本以为在自己的地盘上，尤其是安南首都附近，要剿灭这些倭寇还是很容易的，但是很快他们就发现了，当年大明对于这些倭寇极为头疼，现在轮到安南头疼了。
这些倭寇武艺确实是不错，而且他们根本不进攻安南的城镇，而是采取取蝗虫式的战法，也就是对于安南的乡村进行屠戮、劫掠，这也是倭寇的最常用的办法之一，安南军队如果分兵保护乡村的话，小股安南军队根本不是这些倭人的对手，如果是以大军进剿的话，这些倭人往往根本不和安南大军交战。
而且安南军队和倭人的战法大相径庭，安南军队擅长的是伏击等战术，但是倭人作战毫无章法，随性而为，很难预测他们的行踪，而且倭人每到一地，就对安南乡村予以屠杀、劫掠，除了获取补给之外，剩余的战利品带不走的就予以焚毁，将升龙府附近搅得是天翻地覆。
沉重的破坏了安南的农业生产，这正是朱载坖所要达到的效果，朱载坖很清楚，朝廷要想收复安南，必须首先在安南制造混乱，而朱载坖用来在安南制造混乱的工具就是倭人，朱载坖并不指望这些倭人能够消灭多少安南军队，这不重要，而是希望这些倭人在安南制造恐惧，破坏安南的农业生产，从而使得安南国内出现不稳定因素。
升龙位于资源丰富的红河平原, 且距大海较近, 物产丰富，人丁兴旺，既是安南的首都，更是重要的粮食产区，安南地形狭长，主要的粮食产区就是两个，北方的升龙府和中南部的耕地，不过中南部的粮食产区并不在郑松的控制中，而是在阮氏的控制之中，大明只要能够破坏升龙府附近的粮食，对于郑松和后黎朝来说，就已经是极为难受了。
郑、阮两家，虽说是亲戚，但是更是仇敌，嘉靖二十四年，阮淦在行营中被莫军降将投毒害死，此后，黎朝朝廷的实权落入阮淦的女婿郑检手中，凡事均可便宜裁决然后上奏。郑检挟天子以令诸侯，名义上是黎朝的右相谅国公，黎朝朝廷实际上却是郑家的囊中物。阮淦的两个儿子阮汪、阮潢也颇有武功，遭受郑检忌恨。阮汪官居左相，备受郑检的打压排斥，最后还被杀死。阮潢惶惶不可终日，决计称病退隐以消除郑检的戒心，同时遣人问计于名士阮秉谦，阮秉谦一言，预示了日后南北分治的态势。“横山一带，万代容身。”阮潢对此深以为然，决意离开黎朝朝廷，到南方发展自己的势力。
到如今阮氏已经在安南南部发展两代了，也算是根基深厚了，即便是郑松能够攻灭莫氏，但是对于阮氏，也没有什么太好的办法，阮、郑两家在安南南北分治，虽然名义上都是后黎朝的臣子，但是阮氏早就是国中之国了，而且由于南方战事少，南部地区成为相对安定的大后方。而反观北方，瘟疫与战争不断，北方的难民不断涌入南方，阮氏独立割据的资本正在不断充实。
郑松其实一直都有讨伐阮氏的想法，但是他担心大明趁机干预，而阮氏也一直在继续力量，试图报仇雪恨，两边出于一种的微妙的平衡状态，而朱载坖要做的就是打破这个平衡，朱载坖很清楚，阮氏之所以不敢和郑氏翻脸，第一就是郑氏毕竟掌握着大义名分，挟天子以令诸侯的另一种说法叫奉天子以讨不臣，第二就是郑氏的军事实力确实强大，毕竟刚刚攻灭了莫氏，郑氏的实力得到增加，这个时候可以算得上是兵强马壮了，阮氏不敢轻取妄动。
但是朱载坖相信，只要给阮氏希望，他们恐怕不会放过郑氏的，而朱载坖要做的，就是给他们机会，朱载坖明确要求倭人，不要和安南军队交战，朱载坖很清楚，尽管安南军队素质并不怎么样，但是毕竟是正规军，倭人即便是有官军武装，人数毕竟不占优势，安南军队可以用数量优势将倭人耗死，消灭一些安南军队对于大明来说并不是很重要的事情。
对于倭人，朱载坖的命令是很明确的，就是大肆破坏安南的农业生产，到处去杀人放火，使得安南的百姓无法安顿下来耕种，破坏安南的生产，百姓不生产，朝廷就没有赋税，没有赋税，拿什么供养军队？朱载坖不相信安南军队只靠恩芹和忠橙就能作战，同时要帮安南坚壁清野，制造大量的流民，这些百姓无处可去，只有到南方阮氏的地盘上去才能够生存下来。
阮氏实力增强，必然会和郑氏干起来的，这狗咬狗多是一件美事啊，除此之外，朱载坖还要么中南总督李贽和暹罗、占城等国商量，一旦大明要对安南用兵，暹罗占城要为大明借道并且提供向导，大明也会在暹罗采办各种军需物资，朱载坖相信，暹罗、占城是不会拒绝大明的，他们对于安南也是极为厌恶的，安南之前的扩张严重影响了暹罗和占城。