北极冰盖基因库旁的临时实验室，苏晚手持高倍显微镜，凝视紫纹种芯芽尖的意识因子结晶 —— 结晶呈不规则六边形，泛着淡紫色荧光，在显微镜下可见细微的 “信号纹路”，与基因库子库的休眠信号频率完全同步。陆叔用千年苔藓的 “花部提取物” 轻触结晶，提取物瞬间被吸附，荧光减弱 30%，检测仪显示 “结晶可通过苔藓花提取物暂时稳定，但无法彻底清除，且结晶内部藏有‘坐标片段’，经解析指向南大西洋深海据点方向”。
陈墨的档案破解也取得突破：在顾老夫人 1987 年的 “未公开手记” 中，发现一行加密文字：“子库藏于‘地热之心’，需‘双芯共振’解锁，地热为钥，孢意为引”。结合深海据点异常增强的地热信号，众人推断子库极可能隐藏在深海据点下方的 “地热溶洞” 中，与据点共享地热能源。可新的危机随之而来：紫纹种芯的结晶在与子库信号同步时，开始释放 “微量孢意波”，实验室外已休眠的孢子集群出现微弱反应，检测仪显示 “孢意波每增强 10%，深海孢子的活性就提升 5%，若持续同步，会重新唤醒全球孢子”。
陆叔不得不将紫纹种芯放入 “苔藓避光箱”，阻断信号同步，同时紧急培育千年苔藓花 —— 苔藓开花需模拟 “极地极昼环境”，实验室的人工光源功率不足，培育进度仅达 40%，而陈墨的监测传来急报：“南大西洋深海据点的地热信号已突破临界点，据点周围海水温度升高 2c，孢子开始在地热管道内聚集，形成‘孢意流’，正向子库方向流动”。苏晚看着避光箱中微微发光的种芯，意识到：若不尽快解锁子库，孢意流会自行冲开子库大门，释放未知风险；若解锁，又需直面结晶与孢子的双重威胁。
南大西洋深海据点，顾沉舟的潜水队潜入据点下方 1000 米的地热溶洞 —— 溶洞内壁布满 “高温喷口”，喷口周围附着淡紫色的孢子，形成 “孢意膜”，探测器显示 “喷口释放的地热能量中，含‘孢意激活因子’，孢子通过吸收因子形成孢意流，已沿溶洞延伸 500 米，距离子库入口仅剩 300 米”。按木棉手记 “地热控孢” 方案，需用 “双生木棉心材制成的‘地热挡板’+ 千年苔藓抗孢剂”，挡板可阻断喷口能量，抗孢剂能溶解孢意膜。
队员们将心材挡板固定在喷口处，淡绿色的挡板接触高温后释放 “隔热因子”，喷口能量输出减少 60%，孢意流的流动速度从每小时 20 米降至 8 米。随后，队员们喷洒抗孢剂，孢意膜开始溶解，孢子活性从 60% 降至 40%。可就在清理接近尾声时，溶洞深处传来 “轰隆” 声 —— 一处隐蔽的 “备用喷口” 突然爆发，高温岩浆夹杂着大量孢子，冲毁了 3 块地热挡板，孢意流瞬间加速，突破队员的拦截，朝着子库入口冲去。
更糟的是，潜水器的声呐捕捉到 “巨型孢意聚合体” 的信号 —— 聚合体直径达 50 米，由数十亿孢子聚集而成，正顺着孢意流向子库移动，聚合体释放的 “孢意冲击波” 可干扰潜水器电子系统，部分仪器已出现黑屏。顾沉舟不得不下令撤退至安全区域，同时向北极请求支援：“需紧急调运‘双生菌液浓缩弹’，才能摧毁聚合体，否则孢意流将在 1 小时内冲开子库！” 此时，北极的千年苔藓花培育仅达 50%，紫纹种芯的结晶稳定性仍未达标，支援难以即刻抵达。
南极科考站的基因实验室，安娜的团队发现一个关键关联：南极基因种子的隐性激活基因，经解析后与紫纹种芯的结晶信号形成 “互补序列”—— 两者同时激活时，可产生 “双芯共振波”，正是解锁子库所需的 “钥匙信号”。可种子的隐性基因活性已升至 25%，若强行激活，会触发种子内的 “孢意感应程序”，吸引周边孢子聚集，而科考站附近已出现零星孢子，数量达每平方米 100 颗。
“按木棉手记‘双芯稳频’方案，需用‘双生木棉根系分泌物 + 深海冰藻胶’制成‘共振稳定剂’，分泌物可同步双芯频率，冰藻胶能抑制孢意感应！” 安娜从北极调运的根系分泌物刚送达，实验室的孢子监测仪就发出警报：“周边孢子受种子隐性基因吸引，开始形成‘小型孢雾’，正朝着实验室移动，预计 30 分钟后抵达”。队员们立刻在实验室周围布置 “抗孢雾网”，网体浸泡过共振稳定剂，可暂时阻挡孢雾。
激活种子的过程异常艰难：隐性基因激活至 50% 时，种子开始释放 “共振信号”，与北极的紫纹种芯形成跨洋同步，实验室的仪器屏幕上，子库的休眠信号出现波动，显示 “解锁准备进度 30%”。可孢雾已突破抗孢雾网，实验室的空气孢子浓度达每立方米 200 颗，一名队员的防护服滤毒罐失效，出现 “头晕、恶心” 症状，安娜不得不暂停激活，先清理孢雾 —— 这一耽搁，深海传来消息：孢意流已距离子库入口仅剩 100 米，聚合体也已抵达入口附近，子库大门出现细微裂痕。
南大西洋深海子库入口，顾沉舟的潜水队终于等来北极与南极的支援：紫纹种芯的结晶经苔藓花提取物稳定后，活性控制在 8%；南极基因种子的隐性基因激活至 60%，双芯共振波强度达标。顾沉舟的队员将种芯与种子分别插入子库大门的 “双芯锁” 中 ——“嗡” 的一声，大门缓缓打开，内部泛出淡绿色光芒，映入眼帘的不是预期的病毒样本，而是一面 “基因蓝图墙”，墙上显示着顾老夫人的 “终极生态重构计划”：
“通过子库的‘核心基因’，改造现有生物基因，让地球生态适应‘孢意共生’，形成新的‘平衡链’，而孢子集群与双芯，是维持平衡的‘生态锚点’—— 之前的病毒危机，不过是筛选‘适应型生物’的手段”。
可就在众人震惊时，蓝图墙突然变红，子库中央的 “基因核心” 开始发光，探测器显示 “核心检测到‘非预期孢意’，启动‘清除程序’，将销毁所有非适应型生物基因”。原来，深海孢意聚合体突破了最后的拦截，冲入子库，其携带的 “失控孢意” 触发了清除程序，子库内的温度开始骤升，基因样本出现融化迹象。
顾沉舟试图用双生菌液关闭核心，却发现核心的关闭序列需 “顾老夫人的基因授权”；苏晚的紫纹种芯结晶突然失控，与聚合体形成共振，核心的清除范围从子库扩大至全球；安娜的南极种子也开始释放 “适应型基因信号”，与蓝图墙的序列同步 —— 此时，蓝图墙的角落浮现出一行小字：“生态重构，始于孢意，终于人心”，而基因核心的屏幕上，开始倒计时：“清除程序启动，倒计时 10 分钟”。
众人看着失控的局面，突然意识到：顾老夫人的终极阴谋不是摧毁生态，而是强制重构，而他们手中的双芯，既是解锁钥匙，也是终止清除程序的唯一希望 —— 可如何在 10 分钟内，用被孢意污染的双芯，逆转核心的清除指令，成为摆在面前的终极难题。