远征舰队总司令的任命下达后，云航立即投入到舰队筹备工作中。联盟总部从各星域调派了五十艘最先进的星核级战舰、两百艘主力护卫舰，以及一千架经过星核能量改装的“星锐”机甲，组成总规模超过三百艘战舰的远征舰队，旗舰仍为云航的“苍澜号”。
为应对暗域核心的未知环境，陈教授带领团队对“星痕”进行了全面改造——机甲核心融入了高纯度星核晶体，不仅能大幅提升能量储备，还能在暗域能量环境中保持稳定；左臂加装了“星核探测臂”，可实时分析暗域能量波动，规避危险区域；离子战刀则升级为“星陨刃”，刀刃能释放星核冲击波，对暗域目标造成翻倍伤害。
筹备期间，边境却接连发生两起暗域余孽袭击事件——青岩星星核矿场的运输车队遭到不明机甲伏击，三辆运输舰被摧毁，星核晶体被抢走；赤沙星的防御炮塔突然失控，对着殖民城开火，造成数十名平民受伤。云航意识到，这些余孽很可能是暗域留在边境的眼线，甚至在策划更大的破坏，若不彻底清除，将成为远征舰队的后顾之忧。
“林峰，你带领三十架星锐机甲，前往青岩星追查矿场袭击者；苏晴，你带小队去赤沙星检修防御炮塔，找出失控原因，务必揪出幕后黑手！”云航迅速部署任务，自己则驾驶“星痕”在边境空域巡逻，以防余孽再次发动袭击。
两天后，林峰传来消息：“将军！我们在青岩星废弃矿洞发现了暗域余孽的藏身处，他们正在用抢来的星核晶体改造机甲，数量大约有五十架！”云航立即驾驶“星痕”赶去，抵达矿洞时，林峰的小队正与暗域机甲激战。这些改造后的暗域机甲能吸收星核能量，护盾强度远超普通黑甲，林峰的小队逐渐陷入被动。
“星痕”加入战局，星陨刃释放出银蓝色冲击波，直接击穿一架暗域机甲的护盾，刀刃顺势刺入其能源核心。“集中攻击它们的能源核心，星核能量改造让核心暴露在外，是最大弱点！”云航通过通讯器提醒道。
小队迅速调整战术，星锐机甲的肩炮同时瞄准暗域机甲的核心，能量弹密集射出。暗域机甲的护盾接连破碎，核心被击中后，机甲瞬间失控，瘫倒在地。战斗持续了半小时，五十架暗域机甲被全部摧毁，藏身处的星核晶体也被回收。
与此同时，苏晴在赤沙星也有了发现：“将军！防御炮塔的控制系统被植入了暗域病毒，病毒来源是一台隐藏在殖民城的通讯器，我们顺着信号追踪，发现了暗域的秘密联络点，里面有一份加密文件！”
云航赶到赤沙星，破解加密文件后，脸色变得凝重——文件中记录着暗域的“牵制计划”：余孽将在远征舰队出发当天，引爆埋在边境各殖民星的能量炸弹，摧毁星核矿场与防御工事，让联盟首尾难顾，无法支援远征舰队。
“立即排查所有殖民星，找出能量炸弹！”云航下令。舰队与殖民城居民全员出动，经过三天的排查，最终在青岩星、赤沙星等五颗殖民星的关键位置，找到了共二十枚能量炸弹，成功拆除。
清除暗域余孽后，边境恢复平静，远征舰队的筹备也进入尾声。云航站在“苍澜号”的舰桥上，望着整齐排列的远征舰队，星核级战舰的引擎闪烁着银蓝色光芒，星锐机甲整齐地悬浮在战舰两侧，如同一支即将出征的星空军团。
“通知各舰，三天后出发，目标——暗域核心！”云航的命令通过通讯频道传遍整个舰队。他知道，这将是一场比星核防线之战更艰难的征程，但为了联盟的和平，为了守护这片星空，他与远征舰队，已做好了万全准备。