永恒渊是一片悬浮在虚空中的黑色平原，平原下是深不见底的混沌漩涡，漩涡中翻涌的混沌本源足以污染任何境界的修士——气感境修士靠近漩涡，灵觉会被混沌本源同化，沦为没有自主意识的傀儡；元婴境强者的魂核会被旋涡引力撕碎，神魂碎片永世沉沦；即便是混元境修士，混元道果也会被旋涡中的黑色能量侵蚀，法则逐渐失去秩序。
林尘与苏瑶率领的船队在永恒渊边缘停泊，太初鼎的盘古形态释放出金色的防护罩，将船队与混沌旋涡隔离开来。鼎身投射出的扫描图显示，永恒渊的中心矗立着一座“混沌祭坛”，祭坛上悬浮着一颗跳动的“混沌之心”——这颗心脏由纯粹的混沌本源凝聚而成，表面缠绕着从气感境到混元境的所有负面法则，每一次跳动，都向周围释放出大量的混沌能量。
“黑袍人就在混沌之心里面。”苏瑶的银绿色星环指向祭坛，星环的光芒与混沌之心的能量产生剧烈冲突，“他在以混沌之心为媒介，吸收整个洪荒界的混沌本源，现在的力量至少达到了混元境中期。”
林尘的混元境初期法则全力运转，他能清晰感知到混沌之心中流淌的能量波动——那里面不仅有混沌本源，还夹杂着无数被吞噬修士的境界法则，这些法则在混沌能量的作用下，形成了一道“反混元屏障”，屏障的力量足以压制任何低于混元境中期的修士。
“先清理外围的混沌生物，为总攻做准备。”林尘做出决定，他将修士们分成三队：气感境与元婴境修士组成“净化队”，在防护罩内负责净化飘散的混沌能量；合道境修士组成“防御队”，加固防护罩并随时支援；混元境修士则随他与苏瑶组成“突击队”，直接冲击混沌祭坛。
突击队刚靠近祭坛，就遭到了“混沌卫”的阻拦。这些卫士由混沌本源与被污染的修士法则凝聚而成，实力从合道境后期到混元境初期不等：手持长剑的卫士擅长切割法则，能将气感境的灵觉丝线、元婴境的魂核纽带一一斩断；身披重铠的卫士则能吸收攻击能量，将其转化为混沌本源反哺自身；骑着混沌兽的统领更是能释放“境界崩塌”领域，让进入领域的修士境界暂时倒退。
“以混元之力破混沌法则！”林尘的混元剑释放出金绿双色的光芒，光芒中蕴含着创生、太阴、秩序、混沌四种力量，形成一道“混元四象波”。波流扫过之处，切割法则被创生之力修复，吸收能量的重铠被太阴之力冻结，境界崩塌领域则在秩序与混沌的平衡之力下瓦解。
苏瑶的银绿色星环化作一道巨大的“太阴混元网”，网的节点由气感境灵觉定位，网线是元婴境魂核之力，网面则由混元境法则编织而成。混沌卫一旦被网住，就会被层层剥离混沌本源，露出下方被污染的修士法则，这些法则在太阴之力的净化下重新凝聚，等待着被原主收回。
激战中，一位混元境初期修士被混沌卫统领的境界崩塌领域击中，境界暂时倒退至合道境大圆满。他没有慌乱，而是借助倒退的契机，重新梳理了从气感境到合道境的法则，竟在战斗中突破了瓶颈，重新回归混元境初期时，法则比之前更加凝实。“原来境界倒退也能成为突破的契机。”修士的感悟让其他人深受启发，面对崩塌领域时不再恐惧，反而将其视为锤炼法则的机会。
突击队突破混沌卫的阻拦，终于抵达混沌祭坛前。此时的混沌之心已膨胀至万丈大小，表面的负面法则形成了一张巨大的“混沌法则网”，网中浮现出黑袍人的完整身影——他的气息比之前强大了数倍，眉心的黑色菱形印记与混沌之心同步跳动，显然已与混沌之心完全融合。
“林尘，苏瑶，你们来得正好。”黑袍人的声音带着混沌本源的嘶哑，“见证我成为‘万界混沌主’的时刻吧！”他挥手间，混沌法则网释放出无数道黑色射线，射线中蕴含着从气感境到混元境的所有负面能量：气感射线让人陷入感知错乱，元婴射线催生神魂心魔，混元射线则污染道果法则。
“双生混元，法则归一！”林尘与苏瑶的双生羁绊之力完全爆发，两人的混元道果在空中融合，形成一颗巨大的“双生混元道果”。道果释放出的光芒形成一道“秩序之河”，河流中流淌着从气感境到混元境的所有正面法则：气感法则带来清明的感知，元婴法则守护纯粹的神魂，混元法则则稳固道果的根基。
黑色射线与秩序之河碰撞在一起，永恒渊的虚空剧烈震颤。在碰撞的中心，两种力量不断湮灭、重生，气感境的感知与反感知相互抵消，元婴境的神魂与心魔彼此吞噬，混元境的法则与反法则则在更高维度展开较量。林尘与苏瑶能感觉到，黑袍人的混元法则虽然境界更高，却因为过于依赖混沌本源而显得驳杂，远不如他们的双生混元之力纯粹。
“不可能！混沌之力明明是最强大的！”黑袍人看到自己的射线被逐渐压制，脸上露出难以置信的神情，他加大对混沌之心的能量抽取，混沌法则网的光芒愈发璀璨，甚至开始侵蚀秩序之河的边缘。
林尘与苏瑶对视一眼，同时做出决定：“融入混沌之心，以双生混元之力净化本源！”他们的身影化作两道金绿流光，主动冲入混沌法则网，进入了混沌之心内部。
混沌之心内部是一片纯粹的混沌能量海洋，海洋中漂浮着无数被吞噬的修士法则。林尘与苏瑶的双生混元道果释放出柔和的光芒，光芒所过之处，混沌能量开始沉淀，负面法则被一一剥离，露出下方纯净的本源能量。被吞噬的修士法则在光芒中重聚，化作一道道光流，朝着永恒渊外的修士飞去——他们终于重获自由。
黑袍人没想到两人会如此决绝，他试图操控混沌之心挤压两人，却发现混沌能量在双生混元之力的净化下，越来越难以控制。“你们在自毁！混沌之心的能量会撑爆你们的道果！”黑袍人的嘶吼中带着一丝恐惧。
“混元境的真谛，是容纳而非抗拒。”林尘与苏瑶的声音在混沌之心内部回荡，他们的双生混元道果开始吸收净化后的混沌本源，道果的光芒愈发璀璨，隐隐有突破至混元境中期的迹象，“混沌与秩序本就同源，是你偏执地将它们对立，才会走到今天这一步。”
当最后一丝负面法则被净化时，混沌之心停止了跳动，表面的黑色逐渐褪去，露出七彩的本源色泽。黑袍人的身影在纯净的本源能量中逐渐消散，眉心的黑色菱形印记化作一道光流，融入双生混元道果中——那是混沌本源的最后精华，也是黑袍人留给世界的最后馈赠。
永恒渊的混沌旋涡开始平息，黑色平原上绽放出嫩绿的新芽。林尘与苏瑶的身影从混沌之心中浮现，他们的双生混元道果已完全稳固，气息达到了混元境中期水准。太初鼎的盘古形态释放出喜悦的光芒，鼎身显示：永恒渊的混沌隐患已被彻底清除，洪荒界即将迎来新的生机。
突击队的修士们欢呼着围上来，他们身上或多或少都吸收了被净化的修士法则，境界得到了不同程度的提升。林尘与苏瑶望着恢复纯净的混沌之心，知道洪荒探秘篇的混沌终战已落下帷幕，但他们也明白，这并非结束——黑袍人消散前的话语，暗示着混沌的威胁可能来自更遥远的万界，而他们的使命，是守护更多的世界。
混沌之心化作一颗七彩的“本源珠”，悬浮在永恒渊的中心，成为洪荒界新的能量源泉。林尘与苏瑶将本源珠与太初鼎连接，鼎身释放出的光芒笼罩了整个洪荒界，开始修复被混沌侵蚀的土地与法则。
永恒渊的天空露出了久违的阳光，照亮了修士们带着疲惫却充满希望的脸庞。属于洪荒探秘篇的故事即将结束，但属于万界征战篇的传奇，才刚刚拉开序幕。