由于基德“涉嫌”谋杀，警方布下重兵，不仅是为了保护皇冠，更是为了抓捕这位“杀人犯”。博物馆内外气氛空前紧张。
柯南利用他孩童的身份，在博物馆内四处探查，结合周长安那句隐晦的提示，很快发现了几处疑点：山崎博士最近正在撰写一篇关于东皇冠历史渊源的论文，其中涉及对某个家族“守护者”身份的质疑；那位副馆长似乎与某个海外艺术品黑市有不清不楚的联系；而铃木次郎吉的新助理，则对博物馆的安保系统表现出超乎寻常的兴趣。
周长安则利用周氏集团的影响力，从侧面调查了山崎博士的财务状况和近期联系人，发现他最近曾与一位背景神秘的海外收藏家有过秘密接触，似乎涉及东皇冠的“非公开转让”。
线索纷繁复杂，但都指向一个方向——有人想利用基德作掩护，杀人夺宝，或者掩盖某个与东皇冠相关的秘密。
然而，缺乏直接证据。凶手非常狡猾，几乎没有留下任何指向性的线索。
眼看警方逐渐将侦查重心放在追捕基德上，柯南心急如焚。他知道基德是被冤枉的，但如何在不暴露自身的情况下，引出真凶？
周长安看出了柯南的困境。在一个无人的角落，她看似随意地对正在沉思的柯南说道：“有时候，恶人之所以隐藏，是因为阳光不够炽烈。如果有一个他们无法拒绝的‘善’的契机，或许会忍不住主动跳出来，试图将其玷污。”
柯南闻言，眼睛猛地一亮！他明白了周长安的意思！
他找到目暮警官和铃木次郎吉，提出了一个计划：对外宣布，由于山崎博士不幸遇难，且怪盗基德嫌疑重大，铃木财团决定提前结束展览，并于明晚举行一个小型的、非公开的悼念仪式，同时秘密将东皇冠转移至更安全的地点。这个“秘密转移”计划，只透露给有限的几个内部相关人员。
这是一个阳谋。如果真凶在内部，并且目标是东皇冠或者想掩盖秘密，他（或她）一定会在“转移”过程中再次动手，试图在混乱中达成目的。
周长安暗中赞许。这小侦探，果然一点就通。
明晚，悼念仪式在博物馆一个偏厅举行，气氛肃穆。而真正的“舞台”，则设置在伪装成转移路线的地下保险库通道。
周长安没有出现在悼念仪式上，而是如同幽灵般，潜伏在保险库通道的阴影中。柯南则躲在另一个隐蔽的角落，麻醉枪手表已然就绪。
果然，当伪装成安保人员的警察押送着假的东皇冠保险箱进入通道时，一个人影悄然从通风管道滑下，动作迅捷地击倒了队尾的“警卫”（实则是警察），手中拿着正是失窃的最高权限门禁卡和那柄古董匕首的复制品（真品已被警方收做证物）——正是那个眼神闪烁的铃木助理！
“果然是你，北川！”目暮警官带队从暗处冲出。
北川见事情败露，面露狰狞，挥舞着匕首试图劫持近处的“人质”。
就在这千钧一发之际，“咻”的一声，一枚麻醉针精准地射中了他的脖颈。北川动作一僵，难以置信地瞪大了眼睛，缓缓软倒在地。
柯南从藏身处走出，用变声器（通过藏在高木身上的扩音器）揭示了真相：北川是那个海外收藏家派来的商业间谍，山崎博士发现了他们企图利用展览期间复制甚至替换东皇冠的计划，并掌握了证据。北川于是趁机在基德制造混乱时，杀害了山崎博士，并嫁祸给基德，企图一石二鸟。
真相大白，真凶落网。东皇冠安然无恙。