林夜和洛清瑶成功摧毁初代实验室的自毁装置，暂时逃过一劫。然而，当他们转身看向实验室的内部时，一幅令人毛骨悚然的景象映入眼帘。实验室的培养舱矩阵如同一片无边无际的森林，向维度的尽头不断延伸。每个培养舱内，都浸泡着一个洛清瑶的克隆体，她们有着不同的年龄，从婴儿到少女，从青年到成熟女性，仿佛时间在这个空间里被肆意扭曲。
林夜和洛清瑶缓缓走进这片培养舱的海洋，心中充满了震惊和愤怒。他们小心翼翼地穿梭在培养舱之间，每走一步，都能感受到一股压抑而诡异的气息。在众多培养舱中，一个最古老的舱体引起了他们的注意。舱体上显示着编号 “000”，内部浸泡着一个胚胎。经过检测，这个胚胎与初代的基因匹配度竟高达 99.9%。
“这…… 初代究竟在搞什么阴谋？” 林夜看着胚胎，心中充满了疑惑。
洛清瑶也是一脸凝重：“看来初代的计划远比我们想象的要复杂和可怕。”
就在这时，林夜再也无法抑制心中的愤怒，他挥动星纹武装，朝着身边的培养舱斩去。随着一声巨响，培养舱被斩碎，泄露的营养液如同洪水般涌出。这些营养液似乎蕴含着某种神秘的力量，一接触到地面，便让生命母树的根系瞬间暴走。
根系如同疯狂的蟒蛇，迅速穿透实验室的墙壁和天花板，向着天空延伸，最终形成了一座巨大的血肉佛塔。佛塔散发着令人作呕的气息，塔内回荡着所有克隆体叠加的哭泣声。这些哭声仿佛来自地狱深处，充满了痛苦和绝望，让林夜和洛清瑶的内心都受到了强烈的冲击。
“不好，这根系暴走的情况比我们想象的还要严重。” 林夜说道。
洛清瑶点了点头：“我们必须尽快找到解决的办法，否则，整个宇宙都可能受到影响。”
就在林夜和洛清瑶试图控制根系暴走时，初代日志的全息投影突然出现在他们面前。投影中，初代的身影浮现出来，他的脸上带着疯狂的笑容：“清瑶才是原始容器…… 林夜只是培养皿……” 画面切换，显示出初代亲手将星门印记从洛清瑶额前移植给婴儿林夜的场景。
“不！这不是真的……” 林夜看着投影，心中如刀绞般疼痛。他一直以为自己是拯救宇宙的关键，却没想到自己只是初代计划中的一个工具。
洛清瑶紧紧握住林夜的手：“林夜，不管你是不是培养皿，你在我心中都是最重要的人。我们一起，一定能摧毁初代的阴谋。”
林夜看着洛清瑶，眼中闪烁着坚定的光芒：“嗯，清瑶，我们一起。”
在愤怒和决心的驱使下，林夜和洛清瑶继续探索实验室。他们发现，培养舱的供能系统直通往生客栈银铃网络。每个克隆体的心跳都对应着某个星域的黑市交易额，仿佛这些克隆体的生命与宇宙的经济体系紧密相连。
“原来如此，初代通过控制克隆体的心跳，来操控星骸黑市的交易，从而获取巨大的利益。” 林夜说道。
洛清瑶皱了皱眉头：“这也解释了为什么初代要制造这么多洛清瑶的克隆体。他不仅想要利用清瑶的力量，还想通过控制黑市来实现自己的野心。”
林夜和洛清瑶决定摧毁实验室的主控核心，彻底终结初代的阴谋。他们沿着培养舱矩阵，朝着主控核心的方向前进。在前进的过程中，他们遭遇了重重阻碍。不仅要躲避暴走的根系，还要应对实验室中各种自动防御系统的攻击。
这些自动防御系统形态各异，有的是悬浮在空中的能量炮台，不断发射出致命的能量光束；有的是隐藏在墙壁中的机械傀儡，突然跳出来发动攻击。林夜和洛清瑶凭借着默契的配合和强大的实力，一次次化险为夷。
终于，林夜和洛清瑶来到了主控核心的面前。主控核心散发着强大的能量波动，周围布置着层层防御。林夜深吸一口气，调动体内所有的力量，准备发动最后的攻击。
就在林夜即将动手时，所有克隆体突然睁眼。她们的瞳孔中映出药王谷、佛国与黑市的三重毁灭倒计时。倒计时的数字不断跳动，每一秒都仿佛在敲响宇宙毁灭的钟声。
“这…… 怎么会这样？” 林夜看着克隆体瞳孔中的倒计时，心中充满了震惊和恐惧。
洛清瑶也是一脸凝重：“看来初代在克隆体身上设置了终极陷阱。一旦主控核心被摧毁，就会触发三重毁灭倒计时。”
林夜握紧了拳头：“不管怎样，我们不能让初代的阴谋得逞。就算是拼了这条命，我也要摧毁主控核心。”
洛清瑶点了点头：“林夜，我陪你一起。”
林夜和洛清瑶相互对视一眼，然后同时发动攻击。林夜挥动星纹武装，释放出强大的星纹能量，朝着主控核心冲去。洛清瑶则运用自己独特的力量，干扰周围的防御系统。
在激烈的战斗中，林夜和洛清瑶逐渐靠近主控核心。然而，防御系统的攻击也越来越猛烈，他们的身体多处受伤。但他们没有丝毫退缩，坚定的眼神中透露出必胜的决心。
就在林夜即将接触到主控核心时，一道强大的能量光束突然从防御系统中射出，击中了林夜。林夜被这股能量击飞出去，重重地摔在地上。
“林夜！” 洛清瑶大喊一声，朝着林夜跑去。
林夜挣扎着从地上爬起来，擦了擦嘴角的血迹：“我没事，清瑶。我们继续。”
就在这时，林夜突然发现了防御系统的一个弱点。他集中精神，调动体内的星门能量，朝着弱点发动了致命一击。随着一声巨响，防御系统被摧毁，主控核心暴露在他们面前。
林夜毫不犹豫地冲上前去，将星纹武装刺入主控核心。随着主控核心的被摧毁，实验室开始剧烈震动，所有培养舱都出现了裂缝。
“我们快走！” 林夜拉着洛清瑶，朝着实验室外跑去。
就在他们刚刚离开实验室的瞬间，实验室发生了大爆炸。强大的能量冲击将周围的一切都化为了灰烬。然而，药王谷、佛国与黑市的三重毁灭倒计时并没有停止，依然在快速跳动。
林夜和洛清瑶看着倒计时，心中充满了紧迫感。他们知道，一场更为严峻的挑战即将来临……
林夜和洛清瑶在逃离实验室后，迅速分析起当前的局势。他们意识到，想要阻止三重毁灭倒计时，必须找到初代留下的后手。于是，两人开始在周围的空间中搜索线索。
在废墟中，林夜发现了一个隐藏的地下室入口。入口处散发着微弱的光芒，似乎隐藏着什么秘密。林夜和洛清瑶对视一眼，决定进入地下室一探究竟。
地下室中弥漫着一股陈旧的气息，墙壁上刻满了神秘的符文。在地下室的中央，摆放着一个巨大的水晶球。水晶球散发着柔和的光芒，里面似乎封印着某种强大的力量。
林夜和洛清瑶小心翼翼地靠近水晶球，就在他们触碰到水晶球的瞬间，一道光芒闪过，一个全息影像出现在他们面前。影像中，初代得意地笑着：“林夜，洛清瑶，你们以为摧毁了实验室就能阻止我？太天真了！这三重毁灭倒计时是我最后的王牌，你们根本无法阻止。”
林夜愤怒地看着初代的影像：“初代，你这个疯子！我一定会找到破解倒计时的方法，彻底摧毁你的阴谋。”
初代的影像冷笑一声：“那就看看你们有没有这个本事了。” 说完，影像消失了。
林夜和洛清瑶开始研究水晶球，试图找到破解倒计时的线索。他们发现，水晶球中封印着一种神秘的能量，这种能量似乎与倒计时有着密切的联系。
在研究过程中，林夜突然想起了之前在实验室中发现的关于往生客栈银铃网络的线索。他推测，或许可以通过控制银铃网络，来干扰倒计时的运行。
林夜将自己的想法告诉了洛清瑶，洛清瑶表示赞同。于是，他们开始寻找与银铃网络连接的终端设备。
在地下室的一个角落里，他们发现了一个复杂的仪器。仪器上闪烁着各种灯光，显示着与银铃网络的连接状态。林夜和洛清瑶迅速开始操作仪器，试图通过银铃网络来干扰倒计时。
然而，就在他们即将成功时，仪器突然发出一阵刺耳的警报声。紧接着，一群机械傀儡从地下室的各个角落涌出，朝着他们发动了攻击。
林夜和洛清瑶迅速做出反应，与机械傀儡展开了激烈的战斗。林夜挥动星纹武装，洛清瑶则释放出强大的光芒，两人相互配合，逐渐占据了上风。
经过一番激烈的战斗，林夜和洛清瑶成功击败了机械傀儡。他们继续操作仪器，终于成功干扰了药王谷、佛国与黑市的三重毁灭倒计时。倒计时的数字停止了跳动，危机暂时得到了缓解。
林夜和洛清瑶看着停止的倒计时，心中松了一口气。但他们知道，初代的阴谋不可能如此轻易地被终结，宇宙的未来依然充满了未知的危险……