回到自己的巢穴之后，努尔哈赤是更加的颓丧了，这些女真人的士气也是更加的低落了，努尔哈赤很清楚，他连官军的一路偏师都无法战胜的话，面对张元功和严绍庭的官军主力，那就更没有战胜的希望了，这点他是非常之清楚的，至于乞降，他不是没有试过，大明已经是明确拒绝了他。
同时朱载坖还下达了上谕，能斩努尔哈赤首级来献者，给指挥佥事，赏一万元，能生擒来献者，给指挥使，赏叁万元，现在女真人看努尔哈赤的脑袋都像大明银钱，这使得努尔哈赤更加暴虐，疑心病极重，动辄杀人，女真人内部的逃亡之风就更加疯狂了，这使得努尔哈赤更加颓丧了。
而吴汝胤一面向严绍庭报捷，一面渡过浑江，和严绍庭、张元功等会师五女山城，官军将整个五女山团团围住，张元功等人也开始商量怎么攻城了，虽然这座山城是高句丽所建造的，但是现在依旧是十分险峻，易守难攻，直接进攻对于官军来说是极为不智的选择。
从投降官军的女真人处所获得情报来看，整个五女山城最险要的主要是两个地方，第一就是所谓的一夫关，这里路狭窄陡峭，坡度达到60度以上，是五女山上最难攀、也是最险要的地方。当年高句丽王朝迁都至国内城后，仍设驻军守护这片发祥圣地，派了一个叫勃奇的大力士把守此关，据说他用石头做武器，顺着关口方向往下猛砸，多次击退来犯之敌，让敌军望而生畏，可谓“一夫当关，万夫莫开”。
除此之外，还有进山的道路，也是极为险峻的，被称为十八盘，十八盘是一条通向山顶城门的“之”字形千年古道，是2000年前高句丽人修筑的。路面为土或山石，路外边大多砌有矮小的石墙，有部分路段砌了护坡。路面坡度在10度左右，最陡处为40度。这是一条唯一能走车马直达山顶的路，当时高句丽的运输几乎完全依赖这条路。条路曲曲折折，回环旋转，到达山顶，共有十八盘。
除此之外，就是南门与南城墙最为险峻了，五女山城为朱蒙率领高句丽族人于两汉时建造。城开三门，以南门最为易守难攻，地处山城的东南角。南门设计精巧，利用天然断崖为一侧城墙，人工城墙封堵另一侧平缓的山梁，可对进犯到这里的敌人形成两面夹击，易守难攻。山梁上城墙总长近一里，由天然峭壁墙与人工墙连接而成，上端与点将台崖壁密接，下端为横山走向的六十丈长、七丈深的一道断崖，极其巧妙地形成了一个“丁”字形的城门，供出入山城的军民及车马通过，墙里用梭形石，墙外包砌楔形石，层层石头叠砌，分外坚固，被称为“高丽石”，虽经千载，但是仍然极为坚固。
同时山城上还有水源，王兀堂当年也对这座山城进行了大力的经营，储备了大量的物资，所以官军要是强攻的话，势必会造成极大的伤亡，这点张元功等人是很清楚的，所以官军虽然包围了山城，但是一时还没有开始进攻。
不过张元功、严绍庭等人也不会让努尔哈赤闲着的，他们两人之所以行动迟缓，主要是因为所携带的重炮，尤其是重型臼炮运输不便，所以行动迟缓，这次是要佯攻山城，官军惯常所使用的火炮用处不大，但是弹道弯曲，射角大的臼炮反而有了用武之地了。
这种臼炮主要是发射榴弹的，实际上是内部装满了火药的空心铁球。由于身管较长的官军常用火炮膛压过高，容易导致榴弹提前破裂，通常情况下它只能由身管较短的榴弹炮和臼炮发射。炮手在射击前需要预判好飞行时间，确定引信长度，而后引燃装药，在发射的同时点燃引信。榴弹爆裂后产生的碎片对坚固目标影响有限，因此主要用于杀伤人员或马匹。
榴弹的理想目标是位于开阔地带的部队阵列，如果飞行时间拿捏准确， 榴弹在目标头顶前方不远处炸裂，其杀伤效果最为显着。当攻击目标为骑兵时，榴弹不仅会造成相当的破片杀伤，爆炸声也会对马匹造成惊吓。不过，在实际操作中，炮手切割导火管时经常出现误差，榴弹可能会在空中炸裂，或者落地后仍未爆炸，这无疑会导致杀伤效果降低，除了榴弹之外，如果在空心铁球中灌入一些松节油、树脂、动物脂、硫、硝之类的易燃物及助燃物，便可制成用于纵火的燃烧弹。它常用于攻打城市、村落据点，可以破坏房屋、造成人员财产损失。在攻城炮兵落在后方时，燃烧弹和加热到红热状态的实心弹是少数能够给城市造成严重威胁的野战炮兵弹种。
不仅如此，对于这些所谓的山城，臼炮的弹道弯曲，可以将弹丸直接越过城墙投射到城里去，对于城内造成伤亡，极大的打击守军的士气。
所以这次官军携带了不少臼炮，由于臼炮的射角大、弹道弧线高，因此多被用来轰击距离较近、中间隔有山脉等障碍物、无法平射的目标。对于女真人所扼守的山间险要，官军都采取稳扎稳打的态度，先用重炮予以炮击，杀伤守军和打击守军的士气。
然后就是官军使用线膛火铳的神射手和火铳手对于守城的女真人予以火力压制，然后在驱使朝鲜人佯攻试探女真人的火力，等到消耗了女真的各种守城器械之后，官军才会组织兵力予以攻城。
虽然这样攻城的进度不快，但是可以有效的降低伤亡，除了直接攻城之外，张元功还组织投诚的女真人喊话，向这些女真人保证官军不会杀降的，官军只诛首恶，不问胁从，同时官军还不断地向这些女真人陈述赏格，只要能够斩首或者生擒努尔哈赤，高官厚禄，大明都能给。