现在五军都督府的权力虽然比之前大了不少，但是和提督军务相比，还是远远不足的，而且以李如松的资历，真正掌握管理麾下各都司卫所的左右都督，肯定都不是李如松能干的，李如松最多也就混个都督佥事或者都督同知，实际上就将李如松闲置起来，解除兵权，这点朱载坖是很清楚的。
不过申时行说的也是有道理的，李如松这厮，这点也确实是要予以磋磨的，他自己就出身于将门世家，又是马芳所看好的人，一直以来都是受到朱载坖和朝廷的栽培，很多时候有些小错误，朝廷也从不追究，朱载坖也予以宽宥，但是这对李如松来说并不是什么好事。
就以这次为例，如果他李如松低调一点，其实科道也不一定会这么死死的咬住他，搞得申时行这个首辅都亲自下场，要解除李如松的兵权，主要还是因为李如松这厮过于高调了，虽然朱载坖一直强调重将权，提高武将地位和权力，尤其是在指挥作战上的权力，从隆庆以来，武将的地位也得以提升，但是总兵、提督对督抚还是有必要的尊重的，就是戚继光和他老子李成梁，面对督抚大员也得把尾巴夹起来，偏生他就不是和安分的主。
在提督任上，以权任既重，不欲受总督制，事辄专行。督抚大员尚且对他可以忍耐一二，毕竟知道他根底深厚，是朱载坖很看重的年青一代武将，但是这些科道言官才不管这些呢，之前在宣大的时候，就和科道不太过得去，但是巡抚许守谦阅操，李如松引坐与并。参政王学书却之，语不相下，几攘臂。巡按御史王之栋因劾李如松骄横，这次再加上他和任养心的矛盾，使得科道对他穷追猛打，连申时行也认为不能再这么袒护他了。
申时行见朱载坖没有说话，以为朱载坖尚在犹豫，继续说道：“陛下，如松入仕以来，多受恩宠，至于今日，陛下为爱惜人才，宜加以裁抑，方是用人之道也。”
朱载坖说道：“以元辅之意，调李如松到五府，他就是打磨棱角了？朕看未必。”朱载坖对于李如松还是比较了解的，这厮就是胆大妄为，不知天高地厚的主，既然要敲打他，就要好好敲打一下，不过李成梁的面子还是要给，这件事情必须要朱载坖亲自来办才行，否则的话，极易引起尚在西域作战的李成梁内心的不满，这点朱载坖还是很清楚的。
朱载坖给李成梁一份密旨，主要是详细说明了现在科道咬住李如松，同时李如松自己也不检点，包括他弟弟李如柏也是，在京师也多次被御史弹劾，朱载坖向李成梁解释了自己要处分李如松的原因，主要是要打磨他一下，然后才好用他，对李成梁，朱载坖仍旧是信任的，此事与李成梁无关。
给李成梁的密旨发出之后，朱载坖才正式下达旨意，解除李如松提督蓟镇、大宁军务的职务，召回京师听勘，而在李如松回到京师的时候，锦衣亲军都指挥佥事、成国公朱应桢已经在等着他了，朱应桢拦住李如松说道：“李佥事，上谕命本爵押李如松赴西苑！”
说罢锦衣亲军上前直接将李如松控制住，押往西苑，朱载坖并没有直接见他，而是将他押到了太子朱翊釴那里，李如松和太子的关系是很亲密的，他是太子的伴读出身，后来担任勋卫也是在东宫当差，所以和太子关系很好，这厮也确实是仗了太子的势，张狂的有些过分了，朱载坖才决定敲打他。
李如松一见是把他送太子这里，便觉得没什么大事了，朱应桢向朱翊釴传达了朱载坖的口谕：“李如松是东宫出来的，太子先管教！”
朱翊釴当然知道这次为什么要把李如松罢官，朱翊釴指着这些弹章说道：“李小公爷，要不要看看这些奏疏，上面可都是你的好事啊！”
李如松当然这些弹章弹劾他什么，赶紧低声说道：“殿下，臣知错了。”
朱翊釴看了他一眼说道：“那你说说，你错在哪里？”
李如松赶紧说道：“臣不该和督抚争座次，不该藐视巡按。”
朱翊釴冷笑一声说道：“避重就轻，谁爱管你那些争座次的破事，你准备打参政王学书，这事怎么不说啊？”
李如松说道：“臣并没有打他。”
朱翊釴直接说道：“成国公，这可是只死鸭子啊！给他念来。”
朱应桢取出了锦衣亲军的密档，详细记录了他这次争座次的事情：“抚臣阅操，如松引坐与并，学书力却之，语不相下，竟为披发之争。”
朱应桢念完了之后，朱翊釴骂道：“李如松，你长本事嘛，和朝廷命官动手动脚，你想干什么？想当蓝玉啊？堂堂大将，为了座次，披发互殴，传出来岂不为天下笑，大明的大将就是这样的货色，东宫出来的人就是这样的货色，你不要脸孤还要呢！”
见朱翊釴发火了，李如松也赶紧认怂道：“殿下，臣知错了。”
朱翊釴继续骂道：“你知道什么？不光是你，还有你那个好弟弟李如柏，要不要听听御史是怎么弹劾的，如柏暨诸弟放情酒色，白日为非，竟不顾人，大明勋臣的脸面就被李家丢尽了，襄公国朝名将，怎生有你们这样的子弟，马公当年怎么会收你这样的弟子，孤看马公怕是打了眼了。”
朱翊釴这么说，李如松只得低头不语，当年马芳确实是对他青眼相加，多次说李如松他日必为良将，对他也是倾囊相授，有马芳的抬举，再加上自己是国公世子，东宫出身，李如松是要风得风，要雨得雨，三十二岁就担任副将，三十五岁就担任总兵，四十岁就担任提督，其晋升之快，在大明都是绝无仅有的。
朱翊釴将这些弹章扔给他，说道：“给孤一字一句念，念完了再说。”