这次赏赐之丰厚，几乎是大明立国以来所未有的，不仅仅是官爵的赏赐，金银粮秣的赏赐也是极大的，幸好主要都是内帑支出的，否则的话太仓是很难支应的，不过大明这次收获也是不少。
大量的牛羊马匹被缴获，马匹和骆驼可以为官军所用，牛可以作为耕牛，这些牲畜的皮毛可以作为官军的衣物，尤其是现在朝廷要在吉林推广屯垦，依靠棉衣是很难御寒的，需要大量的皮裘用以御寒，还有所虏获的人口，主要是女人，在朱载坖的命令下，主要配给辽东、吉林都司未婚士卒为妻，朝廷还要给这些士卒们一笔钱财，用于置办家产，有了家庭之后才能够加快在辽东的屯垦。
而且除了大明从各地抽调而来的卫所士卒之外，朱载坖还命令辽东、吉林等地方官府，鼓励女真人也一道屯垦，成为大明的编户，吸引女真人出山屯垦。
而大明这一战对于土默特部的影响同样很大，土默特部很清楚土蛮肯定不是大明的对手，但是没有想到大明这么轻易的就战胜了土蛮部，还将图们汗生擒了，官军所展现出来的战斗力使得土默特部极为震惊，当然黄台吉也不白跑，他也收拢了一些土蛮的小部落，但是土蛮部的台吉们等大人物，黄台吉都是交给了大明的。
这一战下来，使得土默特部和大明的关系更加融洽，顺义王主动将朝廷进贡马匹和九白，同时请求扩大和大明的贸易，再次向大明朝廷表示愿意世守臣节，为大明藩篱，和大明扩大朝贡贸易，朱载坖也接受了顺义王所贡来的礼物，给顺义王下诏安抚，表示只要顺义王能够谨守臣节，就能够永享富贵。
而在进行了一系列礼仪活动之后，征虏大军终于各自回归本镇了，而朱载坖则是再次召集文武重臣们，商量有关大明官军的各项改革措施。
现在各都督府和行都督府已经开始运作了，朱载坖命令组建了总后勤部，但是尚未任命人选，这个职务，权力极重，对于官员的能力要求也极大，既要熟悉军务，还有会理财，这样的人在大明是不多的，吏部经过廷推之后，向朱载坖推荐两人，第一是南京户部左侍郎署部事毕锵，第二是右都御史总督闽浙张学颜，朱载坖问道：“大冢宰说说这两人。”
吏部尚书杨巍于是向朱载坖和在坐的重臣们介绍了这两人，毕锵是嘉靖二十三年进士，资历深厚，在现在的大明，能够在科名上超过他的已经不多了，而他经被海瑞荐为户部右侍郎。后任刑部右侍郎、户部左侍郎总督仓场等职，不久升南京户部左侍郎署部事，对于财政方面的事情是极为了解的，在地方任职的时间也很久。
而张学颜则是熟悉军务，对于官军极为了解，而且在朝中一向以作风严苛而闻名，在闽浙总督任上，厉行清丈田亩，厘革溢额、脱漏、诡借诸弊，得官民屯牧湖陂地八十余万顷。吏部认为以张学颜作风强硬，能够推动朝廷的各项改革措施落地。
但是朱载坖很清楚，张学颜和张居正关系匪浅，但是毕锵和张居正关系不好，所以尽管是海瑞多次上疏推荐的人，但是张居正很显然不喜欢他，所以直接将他打发到南京户部去了，朱载坖思考了一下之后说道：“闽浙要地，仍需重臣弹压才行，以毕锵加户部尚书署总后勤部。”
虽然确定了人选，但是总后勤部怎么运作还是一个重要的问题，他是军中的财政部门，专门负责军队的粮饷军资等事项，关系极重，所以要和文武重臣们一道商量，原本官军的后勤大将们的话语权并不大，主要负责此事的是地方的督抚们，他们负责为辖区的官军提供后勤保障，一般实施的是奏销制度，通过估报、预拨、支放、报销四个环节保障官军的后勤。
奏销制度现在已经很难适应官军的大规模作战了，流程缓慢，户部和地方之间经常因为军费开支而扯皮，导致军费无法报销，朱载坖也认为应当在官军之后一样建立预算制度，将官军的开支分为常费和战费两部份，常费即官军日常的粮饷、训练等开支，这个是可以按照员额明确确定的，也就是所谓的常费。常费以年为单位进行预算决算。
还有就是战费，一旦官军进行各种军事行动，所耗费的开支就是战费，战费的开支肯定是不能确定的，所以要特别计算，先用再奏报即可，对于这个大的方案，在场的文武重臣们也都是同意的。
戚继光和李成梁等大将们关心的是有关各级后勤衙门与饷银发放的问题，戚继光就说道：“陛下，军饷干系三军士气，向者哗变等事，多由粮秣之事所致，故不可不重也！”
戚继光说的是实话，官军闹饷、哗变的事情并不罕见，粮秣问题始终是影响大明官军纪律和战斗力的重要因素，这次改革的主要目的就是为了保障官军的粮饷，稳定军心，从而为之后的整肃军纪做准备。
内阁和户部拟定了军需官十款，分别是：一、军需官长不准与各级将校兼理私账。
二、镇协标营饷银专归各镇后勤司正军需官副军需官与各营军需长担任经理。
三、具领薪各款，均归各将校查考后始行盖印。
四、镇属薪饷及两协薪饷，均归正军需官向总后勤部请领，由总兵及各协副将、参将领盖印。
五、各标薪饷归各标副军需官向镇后勤司请领，由各该管参将盖印。
六、步马炮工各营薪饷柴价，均归各该营军需长向后勤司请领，由各营管带盖印。
七、步马炮骡马粮秣归副军需官向后勤司请领。工辎骡马粮秣，由该营军需长向后勤司请领。
八、每营每月造饷册两份、饷册两扣，一送后勤司领饷，一送总后勤部查考，放毕送正军需长处备查。
九、各项军饷银钱，如有短少假色，均惟各该经手军需官长是问。
十、保护运送粮饷，均由带兵官派兵，由各该军军需长押送。倘在途因看守不严失事，军需官长与管带将校分任其责。